Kesehatan, News Update

Kisah Menarik Dalam Pandemi COVID-19

April 20, 2020

Novel coronavirus dan kemunculannya di kota Wuhan, Cina, telah menyebabkan pandemi besar COVID-19 dan menyebar ke lebih dari 70 negara dan merupakan produk evolusi alami, menurut hasil yang dipublikasikan hari ini. dalam jurnal Nature Medicine. Analisis data publik tentang urutan genom SARS-CoV-2 dan virus terkait tidak menemukan bukti apakah virus itu diproduksi atau dirancang di laboratorium.

“Dengan membandingkan data lokasi genom yang tersedia untuk jenis virus corona yang diketahui, kita dapat menentukan dengan pasti apakah SARS-CoV-2 berasal dari proses alami,” kata Kristian Andersen, PhD, profesor imunologi dan mikrobiologi di Scripps Research dan penulis terkait.

Kecuali Andersen, penulis artikel, “Asal Proksimal SARS-CoV-2,” termasuk Robert F. Garry dari kampus Tulane; Edward Holmes dari University of Sydney; Andrew Rambaut dari kampus Edinburgh; W. Ian Lipkin dari kampus Columbia.

Coronavirus adalah keluarga besar virus yang dapat menyebabkan penyakit yang sangat serius. Penyakit kronis pertama yang diketahui disebabkan oleh coronavirus adalah pandemi sindrom pernapasan akut (SARS) 2003 di Cina. Wabah penyakit kronis kedua dimulai di Arab Saudi pada 2012 dengan Middle East Respiratory Syndrome (MERS).

Pada 31 Desember tahun lalu, faksi yang berkuasa di China memberi tahu Organisasi Kesehatan Dunia mengenai epidemi virus corona baru yang menyebabkan penyakit kronis, yang kemudian dinamai SARS-CoV-2. Pada 20 Februari 2020, hampir 167.500 masalah COVID-19 didokumentasikan, meskipun banyak masalah lebih mudah diidentifikasi. Virus ini membunuh lebih dari 6.600 orang.

Tak lama setelah pandemi dimulai, para ilmuwan Cina mengurutkan genome SARS-CoV-2 dan membuat data tersedia bagi para peneliti di seluruh dunia. Data urutan genom yang disediakan telah menunjukkan bahwa pemerintah Cina dengan cepat menyadari pandemi dan apakah jumlah masalah dengan COVID-19 meningkat karena penularan dari orang ke orang setelah 1 x dimasukkan ke dalam populasi manusia. Data berurutan ini digunakan oleh Andersen dan kolaborator dari berbagai lembaga penelitian untuk melacak asal dan evolusi SARS-CoV-2 dengan berfokus pada karakteristik spesifik virus.

Beberapa ilmuwan menganalisis pola genetik untuk meningkatkan protein, perlindungan luar dari virus yang mereka gunakan untuk menangkap dan menembus dinding luar sel manusia dan hewan. Lebih khusus, mereka fokus pada dua karakteristik penting peningkatan protein: reseptor binding domain (RBD), sejenis kait yang berisi sel inang, dan tempat pemisahan, pembukaan kaleng molekul yang virus sangat mungkin merusak dan masuknya sel inang.

Tes evolusi alami

Para ilmuwan telah menemukan bahwa sisi RBD dari peningkatan protein SARS-CoV-2 telah berevolusi untuk secara efisien menyerang karakteristik molekuler di luar sel manusia yang disebut ACE2, reseptor yang terperangkap dalam pengaturan tekanan darah. Meningkatkan protein SARS-CoV-2 sangat efektif dalam mengikat sel manusia yang berbeda, itulah sebabnya beberapa ilmuwan mengaitkannya sebagai hasil seleksi alam dan bukan sebagai produk eksperimen genetik.

Bukti evolusi alami ini didukung oleh data pada tulang punggung SARS-CoV-2, komposisi molekul keseluruhan. Ketika seseorang mencoba memanipulasi virus korona baru untuk bakteri, mereka akan melakukannya dari tulang belakang virus yang diketahui menyebabkan penyakit. Tetapi beberapa ilmuwan telah menemukan bahwa tulang punggung SARS-CoV-2 tidak sama dengan metode signifikan yang ditemukan pada coronavirus yang dikenal dan, secara umum, seperti virus terkait yang ditemukan pada kelelawar dan trenggiling.

“Dua karakteristik virus ini, perubahan dalam porsi RBD dari peningkatan protein dan tulang belakang yang tidak sama dengan yang lain, tidak peduli dengan kecurangan laboratorium untuk kekuatan asli SARS-CoV-2 “Kata Andersen. .

Josie Golding, PhD, pemimpin pandemi Wellcome Trust yang berbasis di Inggris, menjelaskan Andersen dan beberapa temuan rekannya “Penting untuk memberikan pandangan berbasis bukti tentang masalah yang tersebar luas mengenai asal-usul virus (SARS). -CoV). -2) menghasilkan COVID 19 “.

“Mereka terhubung jika virus adalah produk evolusi alami,” tambah Goulding, “mengakhiri tawaran untuk pengujian genetik yang disengaja.”

Kemungkinan asal virus

Berdasarkan analisis sekuensing genom, Andersen dan rekan-rekannya terhubung jika peluang asli untuk SARS-CoV-2 mengikuti salah satu dari dua garis putus-putus yang mungkin. Dalam naskah, virus berevolusi untuk menghadirkan kondisi bakteri melalui seleksi alam pada inang bukan manusia dan melayang ke manusia. Ini adalah bagaimana epidemi virus korona awalnya ada, dengan manusia yang terinfeksi virus setelah langsung terkena musang (SARS) dan unta (MERS). Beberapa peneliti berpendapat bahwa kelelawar tangki sangat mungkin untuk SARS-CoV-2 karena mereka sama dengan kelelawar coronavirus. Namun, tidak ada masalah dalam distribusi langsung kelelawar manusia yang terdokumentasi, menunjukkan bahwa tuan rumah rantai peluang tertangkap antara kelelawar dan manusia.

Dalam skrip ini, dua karakteristik protein yang meningkatkan SARS-CoV-2, sisi RBD yang mengikat sel dan di mana virus membelah, akan berevolusi ke keadaan saat ini sebelum mereka memasuki manusia. Dalam kasus ini, pandemi kemungkinan terjadi dengan cepat segera setelah manusia terpapar, karena virus memiliki karakteristik canggih yang menghasilkan bakteri dan dapat menyebar di antara manusia.

Dalam teks lain yang diusulkan, ia melawan virus non-patogen yang naik dari hewan ke inang manusia dan berkembang di bawah kondisi bakteri saat ini dalam populasi manusia. Sebagai contoh, beberapa pangolin coronavirus, mamalia seperti armadillo yang ditemukan di Asia dan Afrika, memiliki sebagian besar pengaturan untuk RBD seperti SARS-CoV-2. Coronavirus anteater dapat menyebar ke manusia, baik secara langsung atau melalui koneksi host, seperti musang atau musang.

Selain itu, peningkatan lain yang tidak merata dalam karakter protein SARS-CoV-2, tempat pemisahan, mungkin telah berevolusi dalam inang manusia, mungkin melalui rotasi terbatas yang tidak diidentifikasi dalam populasi manusia sebelum timbulnya infeksi. pandemi. Para peneliti telah menemukan bahwa situs pemisahan SARS-CoV-2 tampak seperti situs pemisahan untuk strain avian influenza yang telah terbukti menyebar dengan mudah di antara banyak orang. SARS-CoV-2 dapat meningkatkan situs pemisahan ganas dalam sel manusia, dan pandemi dapat dimulai sesegera mungkin, karena coronavirus dapat menjadi lebih umum pada manusia.

Rekan penulis studi Andrew Rambaut mencatat apakah sulit atau tidak mungkin untuk mengetahui di mana teks tersebut paling mungkin. Jika SARS-CoV-2 memasuki manusia dalam bentuk patogen yang berasal dari sumber hewan, kemungkinan epidemi besok meningkat, karena jenis virus yang memicu penyakit ini mungkin masih menyebar dalam populasi hewan dan kemungkinan besar meningkat lagi pada manusia. Kemungkinannya lebih rendah daripada coronavirus non-patogen yang memasuki populasi manusia dan memperbaiki sifat yang mirip dengan SARS-CoV-2.

Modal penelitian ini disiapkan oleh Institut Kesehatan Nasional, Perwalian Amal Pew, Wellcome Trust, Dewan Penelitian Eropa dan Aliansi Beasiswa ARC Australia.